SourceTreeで、コミットするには下記方法でおこないます。
コミットとはGitでファイルの変更をリポジトリに格納することです。
各作業ファイルの保存を終えてSourceTreeを起動します。 「作業ツリーのファイル」に更新されたファイル群が表示されるので、 各ファイルのチェックボックスONにします。
ファイルが「Indexにステージしたファイル」に移動したのを確認 → 「コミット」
更新情報のコメントを入力 → 「コミット」
これで、ローカル上のGitがコミットされ更新情報がローカル内に格納されます。